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此版本为第三版的简易增删版。追加了《汉之云》部分，并据此调整了一些其他的细节内容。此外，将尚难真正确定时代的《轩辕伏魔录》部分移出。
上古神话年代：盘古以盘古斧开天辟地。众神以昆仑仙境中的造物仙鼎进行造世工程。女娲造出了世间生灵，包括人以及妖魔，并以造物仙鼎为原型制造了缩略版——炼妖壶。伏羲以太一之轮决定天下万物的生克规律。不知何故众神升天，昆仑仙境也自人间消失。神农氏尝百草，并以神农鼎敖炼仙药。为了救活病亡之爱女白玉，伏羲取出伏羲琴，而女娲造出女娲石，以伏羲所研究出的“天女白玉轮”救活女儿。昆仑镜自昆仑天宫失踪。崆峒印出现。路西法（撒旦）堕天，赛特前世也随着一起叛乱，并设计反曼陀罗阵。西方魔界入侵中原，中华诸神布下九天结界。
五方天帝并立时代：饕餮被昊天帝以伏魔古镜封印于雍州伏魔山。炎黄之争，氐人族逃避战火来到东海，盘古赐予其水中生活的能力。天女青儿为助爱侣黄帝，携带天神之剑与琴、笛、笙、磬四件乐器落到凡尘。其中四件乐器交付于炎帝之女——巫山女神，而天神之剑则为黄帝所用。后蚩尤与黄帝约战涿鹿，蚩尤败，但天神之剑亦断。天女以自身纯阳之力进行修复，名之为轩辕剑。但修复神剑的同时，天女的体质改变，不仅无法回到天上，更化作“旱魃”之身。黄帝自炎帝手中夺取东皇钟，并以此创造山海界，将炎帝麾下四灵诸侯以及追随他的异种异族（含部分氐人）放逐其中。因天女的体质，人界异变，故黄帝不得已又将天女放逐于山海界。被流放于山海界的天女，又被初代青龙圣者分为灵魄身三者，并以青龙圣兽所化之青龙灵木将天女之身封印。因天女失去回天界的能力，天帝震怒，遂决定不再帮助人类。
人魔大战年代：炎黄之争结束后，人类和妖魔之间的战争愈演愈烈。轩辕剑侠使用轩辕剑，大败妖魔，妖魔分为两派，一类主和，领导者称为“善神”，一类主战，领导者称为“恶神”。轩辕剑壹故事开始十七年前，善神决意联手恶神，和妖魔消灭人类。在一场战役中，大部分人类和妖魔同归于尽，善神、恶神以及轩辕剑侠下落不明。此后，人间处于暂时性的和平，人类与妖魔和平共处。好景不长，几年之后人类组织了轩辕剑帮，对于妖魔咄咄相逼，妖魔的生存受到了极大的威胁。其后，一名自称“恶神”的妖魔巴蛇出现，并给大地带来了许多强大的妖魔，形式逆转。至此，巴蛇所盘踞的火焰山与轩辕剑帮形成长期势力对峙状态，而人间又是一片生灵涂炭。为了牵制轩辕剑帮，巴蛇手下火凤凰绑架了轩辕剑帮帮主之女江如红（小倩）。轩辕剑壹故事开始。人魔最后一次大战之后十七年，轩辕剑侠之子少年何然（燕赤霞）奉师命闯荡江湖。经过一番历练，结识黑衣侠客杨坤硕（宁采臣），在凤凰塔救出江如红，打败火凤凰。轩辕剑壹故事结束。轩辕剑贰故事开始。何杨江三人结伴而行，决意去打倒恶神巴蛇。途中，他们在遇到了离开初建伊始的仙狐村中千年白狐古月圣，以及炼妖壶的管理者壶中仙。打倒了恶神巴蛇之后，按照壶中仙的意思将炼妖壶放入昆仑仙境中的造物仙鼎。但这时女娲出现，告知壶中仙的真实意图——将世界收入炼妖壶。最终何然，杨坤硕，古月圣以及江如红挫败了壶中仙的阴谋，壶中仙的头颅被轩辕剑封印于炼妖壶的鬼神之塔。轩辕剑贰故事结束。
公元前25世纪之前：柒与撒旦沟通，发明黑火。之后柒被封印于金茧，前一代文明古国蜀国也黑火暴走的缘故消失于历史中。
公元前25世纪至20世纪左右：前一代文明的遗民领袖蚕从王重新建立蜀国，留下严禁解除柒的封印的命令。
公元前12世纪左右，山海界中，天女之灵替代衰弱的初代青龙圣者维持天女之身的封印。
公元前11世纪左右（周朝建国）：姜太公在太一之轮上留下了“周克商”的生克（由于太一殿千年一开，时间上有冲突，推测是以类似五岳阵的方法进行）。蜀国内乱，黑火巨人神像被送至刚刚建立起的周王朝，且被周公旦下令铸为九鼎。之后，姜太公将夏后祭器封印在各个奇异的空间中：青龙之圭藏于和齐国大封神台相连的苍龙界；白虎之琥藏于与秦国陈宝祭庙相连的西王母所居昆仑界，并以昆仑镜对其设下结界；朱雀之璋藏于楚国中云梦泽下的湘君界；玄武之璜藏于晋国；黄麟之琮藏于宋国；苍螭之璧藏于周国的九鼎之间。
公元前642年，车芸出生。
公元前642年至公元前629年间，车氏遭到陷害惨遭灭门。车芸得以幸免成为遗孤，但亦被砍去双足，由车氏家臣端木老人抚养。此后，桓远之，嬴诗（慕容诗）先后来到春秋时代。桓远之进入晋国太辰宫，以天书之力得以擢升为太辰宫九龙子之叁龙子负屃。其后，积极推动太辰宫进行五岳阵以使得晋国获得王霸之气（间接影响太一之轮生克）。而嬴诗则与秦穆公之女弄玉相识，成为秦穆公义女，顺利寻找到藏于晋国的玄武之璜。其后，为了寻找青龙之圭，经秦穆公引荐，成为晋文公重耳的贴身保镖。
公元前629年，晋国入侵令狐国，七曜使者来到春秋时代，苍之涛故事开始。车芸回到旧宅寻找木甲技术，其后令狐国灭亡，国君身故。车芸随嬴诗（慕容诗）去了晋国。
公元前628年，晋侯重耳身故。桓远之帮助嬴诗收集夏后祭器。
公元前627年，五岳阵被七曜使者全灭。崤山之战发生。
分支1：在桓远之成功的利用五岳阵使得“晋克秦”后而没有嬴诗回到过去的历史中，此场战争的输赢无法得知，但造成了此历史上的嬴诗想要回到过去改变历史。此历史因为分支2而变得不存在。
分支2：秦大破晋国，慕容诗利用夏后祭器来到昊天界，在太一之轮上留下“秦克晋”的生克，导致出现一个我们完全不清楚的历史。唯一确定的就是七曜使者是来自于那个历史。此历史中，秦国使用了黑火，壶中仙一样难逃死噩，七曜使者是经由犀衍的帮助来到了春秋时代。此历史因为分支3而不存在了。
分支3：晋国在七曜使者的帮助下，赢了秦国。嬴诗死而复生，身份被揭穿。七曜使者和车芸一行都上了昊天界，最后桓远之成功的在太一之轮上留下了“晋克秦”的生克，误杀了车芸，被关在了太一神殿，而太一之轮则被成功封印，七曜使者随着消失，而车芸的记忆转移到了慕容诗的身上。苍之涛故事结束。
公元前459年，鬼谷子弟子蜀桑子立志想要改变天下。他拥有学来的机关术技术，并偷取了辗转落入鬼谷子手中的炼妖壶。不仅如此，蜀桑子对古蜀国文化进行研究，发现了黑火的存在。他在蜀国祭庙中找到了黑火护身符，以此为原料，炼化出了一女孩，取名为桑纹锦，并收之为女儿。此后，他进一步研究了黑火之力后，觉得黑火的力量过于强大，因此放弃。
公元前438年，辅子彻出生。
公元前420年，辅子彻在大梁城黄河堤口遇到机关人，枫之舞故事开始。之后在太室山救下被蜀桑子置于木箱中的桑纹锦，收伏蜀桑子的宠物疾鹏。之后蜀桑子夺走轩辕剑，而壶中仙得以释放，辅子彻将其头部放在机关人上。在桑纹锦以及同门铸石子的协力下，打败蜀桑子，夺回轩辕剑。桑纹锦身世曝光，利用炼妖壶的力量死又复生。枫之舞故事结束。壶中仙开始沉睡，恢复力量。
公元前413年，壶中仙苏醒，发现壶中世界妖魔大乱。
公元前412年，壶中仙找到神器东皇钟和昊天塔，建立云中界。
公元前409年，壶中世界妖魔谋乱，壶中仙欲借辅子彻和轩辕剑之力平乱，同时也和辅子彻初次提及他的谐韵计划。两人意见不合，大打出手，壶中仙败走，但走前，桑纹锦将有关于黑火的记载交给了壶中仙研究。
公元前404年，壶中仙找到黑火九鼎。
公元前403年，壶中仙以黑火的力量平息了壶中世界的叛乱，但是在他试验期间，七鼎黑火肆虐云中界，壶中仙被重创。
公元前398年，壶中仙协助楚国一统天下。辅子彻与壶中仙再战，辅子彻以轩辕剑力破周鼎，并将二鼎送回周国。
公元前397年，壶中仙约辅子彻战于泗水，辅子彻虽然以轩辕剑之力迎战七鼎之力，但是也因此力竭，而与轩辕剑一同被壶中仙封印于炼妖壶中，助阵的疾鹏也被投入云中界。而壶中仙也因为力竭而再次进入休眠期。
公元前400年，壶中仙开始栽培犀衍。
公元前330年，犀衍建立云彩之塔，协调云中界。
公元前300年，疾鹏建立多毛国。
公元前276年，桑纹锦接任墨家钜子一任。
公元前275年，白舆开始研究机关术和黑火一鼎（送回周王室的二鼎之一）
公元前274年，白舆被逐出墨门。
公元前260年，壶中仙开始帮助秦国。
公元前256年，壶中线召回另一个遗留在外的周鼎。
公元前241年，姬良出生。
公元前240年，秦国的机关术发展迅速，研制出巨雷。
公元前235年，屈娴出生。
公元前233年，水镜出生。
公元前221年，秦国统一天下。
公元前219年，嬴政在壶中仙的怂恿下开始求仙。
公元前218年，墨家不断迁移，水镜开始要求研究机关术，姬良博浪沙刺秦失败，轩辕剑肆故事开始。姬良学会使用天书，水镜刺秦失败，营救屈娴成功后一行人被壶中仙抛入云中界。化解了水鱼国和多毛国的战争问题，疾鹏跟水镜一行回到人界。其后，墨家被毁，桑纹锦被抓后被犀衍带至云中界紫云塔囚禁，之后犀衍也将收于蜀之太庙中的封印了柒的金茧带到紫云塔。水镜一行来到紫云塔救出桑纹锦，桑纹锦释放柒。柒重创壶中仙。几经波折，了解了桑纹锦原来是利用黑火护身符所炼化出的，所以会被柒控制。其后，一行进入壶中界，救出辅子彻，获得轩辕剑，打败了想要毁灭世界的柒和九鼎黑火龙。壶中仙就此与世长辞，身体被放入金蛹。姬良改名张良，墨家搬至云中界生活（桃花源雏形）。轩辕剑肆故事结束。
公元前208年，张良开始辅佐刘邦。
公元前201年，张良被册封为留侯。
公元前201~公元前84年间，因重大变故，神器殿中神器失散（与公元383年的分支1并不矛盾，因为该历史分支已经消失）。
公元前84年左右，何然利用崆峒印为氐人设下不老结界。
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公元219年，关羽北伐，暮云之母死于逃难途中。暮云与姐姐以及哥哥朝云失散。
洛阳少年徐暮云，幼时遭逢变故，流落荒野，幸得魏国前御史中丞徐庶所救，将之收为养子，抚养成人。在洛阳的那段童年时光中，暮云与青梅竹马兰茵、以及魏国名将张郃之孙张诰相交甚笃，一同习剑成长。十年匆匆，暮云如今已是英姿焕发、名满洛阳的少年剑客，但为求精进，暮云始终勤练剑术，希望有朝一日能以一身武艺协助恩师张郃，报效朝廷……纪元二二六年，魏帝曹丕猝然而逝，留下年纪尚轻的新帝，以及尚未稳固的社稷；屡次交兵的南方孙权本就蠢蠢欲动，而沉寂多年的西川蜀汉，更于丞相诸葛亮令下，于纪元二二八年也开始频频出兵进犯，使得朝野陷入了人心徨恐的动荡里。在此之时，暮云受到义兄曹侍中之托，屡次前往战场协助魏军作战；然而，由于徐庶曾与蜀汉之刘备、诸葛亮、赵云等人相交甚笃，极为担心老友安危，因此十分反对暮云参与战事，让暮云深陷在父亲与义兄的矛盾立场里……
公元196年，天女青儿的四件乐器所化人形的老三笙儿（横艾），与年仅16岁的诸葛亮初逢。
公元205年，曹植与嫂嫂甑宓私通诞下二子，一子即为曹睿，另一子流落民间。
公元208年，赤壁之战，笙儿的大姐巫山仙子琴儿以自己百年寿命为周瑜借来东风，轩辕剑转世双生子——朝云与暮云的父皇甫疾死于赤壁之火。
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