小智：
刺刺耳皮丘：小智的初始神奇宝贝，由大木博士给予的蛋孵化而来，特性是避雷针，左耳上有三个刺刺，由于未知原因不可以进化，但可以学习所有的电系技能。
哈克龙——快龙：野生原野区收服的迷你龙，橘子群岛时进化为哈克龙，在桔梗道馆打败比雕而进化为快龙。
吉利蛋——幸福蛋：彩虹市游戏厅兑换来的蛋孵化的好运蛋，橘子群岛时进化为吉利蛋，打败火箭队后进化为幸福蛋。
赫拉克罗斯：在赫拉克罗斯森林收服，非常的喜爱喝树汁，后来被小智的甜蜜所俘虏。
菊草叶：携带了不变石，个性好强，非常的喜欢小智，对于小智异常的依赖。
尾立——大尾立：对于尾巴的使用炉火纯青，在桧皮镇打败火箭队进化为大尾立。
喷火龙：现寄放于喷火龙山谷，实力强劲，小智的元老级神奇宝贝。
毽子草——毽子花——毽子绵：对于风的掌控力已经赶上了巴大蝴，收服小锯鳄时进化为毽子花，打败了一只毽子花而进化为毽子绵。
咩利羊——绵绵——电龙：早产虚弱而引起了孤僻，小智开导后跟随了小智，满金道馆打败尼多娜进化为绵绵，收服黑暗鸦时进化为电龙，善于强化自己各项来令对手无法抵抗。
火球鼠——火岩鼠——火暴兽：被小智诱拐的呆萌的火球鼠，慢热，闪避一流，在捕虫大会进化为火岩鼠；雪拉比的时空，打败巨钳螳螂进化为火暴兽。
哈克龙：野生原野区收服，头上的角上有一个十字疤痕，不喜战斗，擅长天气掌控。
皮卡丘色皮丘：称为小皮，和皮丘是姐弟，电流不会因皮丘的避雷针特性而被吸收，在桐树林收服，也因未知原因不可进化，可学习各种电系技能。
肯泰罗：野生原野区收服，喜爱奔跑。
大嘴雀：真新镇外的森林收服，起初，和小智的感情不是很好，在神奇宝贝交换大会这个转折点后，小智对大嘴雀敞开心扉，感情深厚。
戴鲁比——黑鲁加：一群戴鲁比的老大，左脸颊上有一个“叉”形疤痕，右眼睑上也有一道疤痕，在圆朱道馆进化为黑鲁加。
小锯鳄——蓝鳄——大力鳄：喜欢跳跃，以不规则的跳跃来躲避各种攻击。
金色猫头夜鹰：闪光神奇宝贝，体型比普通的猫头夜鹰小，但是智慧超高。
安瓢虫：捕虫大会收服，属于人品极高的神奇宝贝，银色旋风效果触发几率非常的高。
蓝色壶壶：闪光神奇宝贝，喜欢把自己缩在壳里，躲到岩石底下。
阳阳玛——梅卡阳玛：被人驱逐的神奇宝贝，在暴雨中差点死掉，小智救了它，并收复，特别的喜欢玩。
黑暗鸦——乌鸦头头：非常的调皮，喜欢发光的东西。
卡比兽：橘子群岛的果实七岛收复，虽然体型巨大，但是灵活，且速度很快，会游泳，胃口大。
小果然——果然翁：一直独自一人孤独的小果然，喜欢小智而跟随，在黄岩岛进化为果然翁。
巨翅飞鱼：去赤岩岛的路上收复。
大暴鲤龙：橘子群岛收复的，乔伊小姐从小的玩伴。
大超铁暴龙：橘子群岛，大神奇宝贝之岛收服的大铁甲暴龙，后携带保护甲通信进化而来。
大大钢蛇：关东地区米亚查山收服的大大岩蛇，后携带金属外衣通信进化，右脸颊上有十字形疤痕。
蛋——小小象——顿甲：神奇宝贝抚养家交给小智的蛋，喜欢被电击。
红色暴鲤龙：被火箭队的进化电波强制从鲤鱼王进化而来，异常的愤怒，封闭了自己的内心，后被小智所感化，在旅行途中渐渐敞开心扉，融入了小智的大家庭。
巨钳螳螂：橘子群岛的马克特岛收服的飞天螳螂，后携带金属外衣通信进化而来。
大熔岩蜗牛：提醒非常的巨大，背上的壳儿有一道裂痕。
长毛猪——象牙猪：冰之洞窟收服。
拉帝欧斯：水都与小智相遇，因小智的帮助而拯救了水都，主动跟随小智。
拉帝亚斯：非常的喜欢小智，而且亲了小智。
蛋——由基拉：被盗猎者所偷盗，在蛋的时候就经历了不好的事情，孵化后不愿意睁开眼睛看这个世界，在小智的努力下活了下来，决定陪伴这个说“不会抛下他”的人到永远。
狃拉：凤王院收服，地盘意识非常的强。
小霞：
波克基古、玛瑙水母——毒刺水母、可达鸭、蚊香蛙——快泳蛙、菊石兽——多刺菊石兽、沼王、蛋——小锯鳄——蓝鳄、灯笼鱼——电灯怪、蛋——蚊香蝌蚪——蚊香蛙——牛蛙君（降雨）、太阳珊瑚、宝石海星、蛋——露丽丽
小刚：
超音蝠——大嘴蝠——叉字蝠、六尾（归还小雪）、化石盔——镰刀盔、差不多娃娃、榛果球——佛烈托斯、向日种子——向日花怪、九尾
武藏：
阿柏怪、果然翁（大舌头交换）
小次郎：
双弹瓦斯、大食花（已放生）
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